John Robin Warren (lahir pada 11 Juni 1937 di Adelaide) adalah seorang pakar patologi dan peneliti berkebangsaan Australia yang dianggap sebagai penemu bakterium Helicobacter pylori pada tahun 1979. Bersama dengan rekannya Barry Marshall, Warren membuktikan bahwa bakterium tersebut merupakan penyebab sakit maag.
Awalnya Warren telah bertahun-tahun mengamati asalnya bakteri di lambung pasien gastritis, namun ia tidak menyampaikannya di forum ilmiah. Saat itu pendapat tentang peran utama asam lambung yang berlebihan sebagai penyebab sakit maag masih dominan.
Akhirnya pada tahun 1982, bersama dengan Marshall, Warren melaporkan hasil penelitian dalam bentuk surat singkat di majalah Lancet tentang organisme mirip Campylobacter. Penelitian selanjutnya memperkuat bukti bahwa infeksi kuman itu merupakan penyebab penyakit maag.
Pada tahun 2005, Warren dan Marshall dianugerahi Penghargaan Nobel dalam Fisiologi atau Kedokteran.